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Metagenome Sequencing (NGS) Service

특정 환경에 존재하는 모든 생물체를 분석하는 연구 분야로서, 배양 없이 샘플에서 존재하는 모든 미생물의 유전자 정보를 NGS 분석 방법을 이용해 통합적으로 알아내는 분석 방법입니다.
 

  • Feature


    1. Sample Type





    2-1. Amplicon (16S rRNA, 18S, ITS, Customized) Metagenome Sequencing

    환경 샘플에서 PCR 방법으로 다양한 미생물이 섞여 있는 샘플에 어떤 미생물이 존재하는지, 그리고 그 상대적인 양은 얼마인지 분석이 가능한 방법

    • Taxonomic profiling  
    • Comparison analysis of microbial community
    • Diversity statistics (alpha-,beta- diversity)
    • OTU(Operational Taxonomic Unit) 클러스터링, 분석
    • ASV(Amplified Sequence Variant) 분석
     







     


    2-2. Shotgun Metagenome Sequencing
    환경 샘플에서 추출한 DNA를 무작위로 쪼개서 작은 조각을 시퀀싱하여 미생물의 종 구성, 유전자 기능 및 대사경로를 연구하는 방식의 분석 방법

    • Remove host sequences
    • Metagenome assembled genomes
    • Prediction genomic region
    • Gene annotation
    • Taxonomy assign








     

  • 3. Sequencing Platform


    • Oxford Nanopore technologies (ONT)
    • Illumina
    • PacBio

  • 4. Work Flow

  • 5. Other NGS Bioinformatics Service


    • Whole genome sequencing                                                     • RNA sequencing
    • Whole exome sequencing (Human, Animal)                     • Small RNA sequencing (miRNA)
    • Korean Chip.v2                                                                             • Epigenome
    • DTC Service                                                                                    • Metagenome
    • 16S (V3-V4, V1-V9), 18S, 23S, ITS, CO1 etc.                               • SNP/SSR/INDEL                                            
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