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[Amplification] 프라이머(Primer)란?

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작성일 2024-11-22 14:49:29 조회수 135
안녕하세요.

바이오팩트 학술팀입니다.

오늘은 PCR에 필요한 구성 요소 중 하나인 프라이머(Primer)에 대해 알려드리겠습니다.

#프라이머란?
"프라이머(Primer)"는 DNA 또는 RNA 증폭 과정에서 사용되는 작은 단일 유전자 조각입니다.
이는 증폭하고자 하는 특정 유전자 또는 DNA sequence와 상보적으로 결합하여 DNA 합성 과정을 시작 시키는 역할을 합니다.

보통 17 ~28 mer 정도의 길이로, 화학적으로 합성된 올리고뉴클레오타이드(oligonucleotide)입니다.
프라이머는 일반적으로 핵산의 염기 구성에 따라 A(아데닌), T(티민), G(구아닌), C(시토신)와 같은 염기로 이루어집니다.

Primer Design Guide
다양하게 design 할 수 있으나, 아래와 같이 design 하시길 권장합니다.
1. Length : 17 ~ 28 mer (Tm = 55 ~ 80 ℃)
2. Base composition : 50 - 60% (G+C)
3. Forward와 Reverse primer의 Tm 값이 비슷하도록 설정
4. 피해야 할 region : 1) G + C rich region
                           2) Repeat 및 2차 구조

Design Rule (= The Wallace rule)
*Annealing Temperature =Tm – (4 ~ 6 ℃)
Tm (℃) = 2(A+T) + 4(C+G)
(A+T) = sum of A and T residues in the primer
(C+G) = sum of C and G residues in the primer

감사합니다.
#PCR #Primer #실험 #set-up #design #증폭 #프라이머

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