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[Amplification. Sequencing] 동정(식물동정, 동물동정, 미생물동정)

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작성일 2023-02-02 16:04:20 조회수 738
동정은 동물, 식물, 미생물 등등 여러가지 방법을 이용하여 각종 검색표 등에 의하여 비교 검토후 이미 밝혀진 분류군 중에서 어느 위치를 결정하는 것입니다. 
바이오팩트에서는 미생물동정(16S, 18S 분석), 동물곤충조류등등 동정 (COI gene), 식물동정 (ITS1,4/ rbcLa) 모두 가능합니다. 
genomic DNA추출부터 PCR-정제-sequencing-bioinfomatics까지 Full service로 진행해드립니다. 
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미생물동정의 경우 
① 분리된 균 주가 미생물 분류체계 어디 단계에 속하는지를 결정
② 각 종의 분류기준 특성을 조사하여 여러 균 종들과 비교
③ 최근 Ribosomal RNA (rRNA) 염기서열 분석 방법을 이용한 미생물 동정이 가장 널리 사용하며 27F, 1492R primer로 증폭 분석합니다. 

동물동정의 경우
어떤 동물인지 미토콘드리아의 유전자를 분석해서 종분석을 진행합니다. 
미토콘드리아는 일부를 제외한 거의 대부분의 진핵생물에 존재하며 미토콘드리아 유전체는 하나의 세포 안에 수백에서 수천 개의 사본이 존재합니다. 
미토콘드리아 유전체의 37개 유전자 구성 요소 중 COI 영역은 동물의 barcode를 구축하는 주요 유전자이며, 16S rRNA 유전자나 control region 또는 pseudo-control region, CYTB 유전자 등은 종을 구분하거나 집단 유전학적 연구를 위한 주된 표지인자로서 이용되어져 왔습니다. 이 외에도 COI, COII, COIII, ND1, ND2 등을 포함한 많은 유전자 영역들이 동일 목적으로 사용되어 왔습니다.
https://species.nibr.go.kr/UPLOAD_TOTL//CMS/424/content.htm;jsessionid=0Z0aEu2HSXB6mmD8QyVRJyj5RBy2a4Ey0JPtBaek2ZvKKh5NbkhmB7MPRdmpLQtD.totl_was_servlet_engine1 (인용)

식물동정의 경우
기존에 수집된 표본 또는 분류 도감과 비교하여 알려지지 않은 식물의 정체를 결정하는 것으로 식물계를 구성하는 모든 식물을 명명하고 기재하며 무리로 나누어 계통체계를 세우고, 계통 간의 관계를 밝히는 학문입니다. https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%8B%9D%EB%AC%BC%EB%B6%84%EB%A5%98%ED%95%99(인용)
엽록체 barcode marker로 알려진 엽록체 trnL intron, trnL-trnF IGS, psbK-psbI IGS, psbA-trnH IGS, rpoC1 유전자 등등으로 분석진행합니다.  

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