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제품소개
SERVICE

Genotyping Service

Genotyping Service는 고객님께서 형광을 이용한 Product 산물 (primer, adapter, kit, 제한효소처리 등) 을 보내주시면 분석기기에 Running 하여 data를 제공하는 서비스 입니다. 일반 Genotyping Running, AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), T-RFLP (Terminal-Restriction Fragment Length Polymorphism), SSR(Simple Sequence Repeat)을 분석 후 Data를 제공하고 있습니다. 이런 Genotyping 서비스는 분자 마커를 이용한 계통분류, 질병관련 유전적 변이 여부 확인, 집단 및 군집 내에서 개체간의 유전적 관계 분석 및 미생물 군집 구조 및 다양성 분석 등 광범위한 유전학적 분석에 이용되고 있습니다.

  • Genotyping

    • Genotyping 기기 정보

      • ABI 3130XL Genetic analyzer (36 cm capillary)
      • ABI 3730XL Genetic analyzer (50 cm capillary)

      Fluorescence dye

      • 원하는 gene의 개수에 따라 marker의 종류가 달라질 수 있습니다.
      • Ladder로 500ROX 이용 시 : FAM, HEX, NED 이용 가능
      • Ladder로 500LIZ 이용 시 : FAM, VIC, NED, PET 이용 가능

      * NED, VIC, PET의 경우 해외 주문만 가능하므로 주문 시 최소 1달이 소요 될 수 있습니다.
      상단 표를 참고해주세요

Only Genotyping Running

보내 주시는 샘플을 ABI 3130XL Genetic analyzer (36 cm capillary)에 단순히 running 해 드리는 서비스로 고객님이 running 전단계의 실험을 마치고 보내주시는 샘플을 적정 농도와 running 방법으로 실험하는 서비스입니다.

  • Feature

    • 유의사항

      • Fluorescence dye를 tagging한 primer로 PCR한 샘플이 준비되었을 경우, genotyping running만 의뢰하여 주시면 됩니다.
      • 최소 분석 수량과 단위 : 16 sample (1개를 의뢰하셔도 16개 의뢰 가격이 청구됩니다.)
      • 준비 방법 : 96 well PCR plate 또는 8-strip tube 에 담아 빛을 차단하여 전기 영동한 사진을 함께 보내주세요. (전기영동 사진이 없을 경우 비용이 청구됩니다.)
      • Product size : 500 bp 미만
      • Multiplex running : 단일 밴드 증폭 산물을 따로 분리해서 보내주시고,mix 할 세트를 정확히 명시해야 합니다.

    • 실험 기간

      • 1주일

    • 결과 전송

      • .fsa 파일을 e-mail로 보내드리며 추가 분석 요청 시 추가 비용이 발생 할 수 있습니다.
      • Peak scanner 프로그램을 원하시면 무료 제공

    • 보관 기간

      • 결과 data는 전송 후 6개월 보관. 샘플은 결과 전송 후 2주 보관.

  • 분석과정 (Work Flow)

    • STEP.01샘플 접수

    • STEP.02샘플 농도 확인

    • STEP.03기기 Running

    • STEP.04결과 분석 및 전송

Microsatellite / STR / SSR / VNTR Service

Microsatellite (MS) 혹은 STR (Simple Tandem Repeats), SSR (Simple Sequence Repeats), VNTR (Variable Number Tandem Repeats)은 반복된 염기서열의 크기를 분석하는 방법으로 repeat unit에 따라 다양하게 명명되고 있습니다. 이러한 반복 염기서열은 다형이 매우 심해 genome mapping의 marker로서 이상적이며, 전체 genome에 고르게 분포되어 있습니다. 주로 같은 종에서 특이점을 확인 할 수 있는 marker를 알아보는 데 이용되며, 이미 많은 수의 SSR marker 가 발견되어지고 있습니다. 이미 밝혀져 있는 marker를 여러 개의 sample로확인하는 과정에 대한 실험을 진행하고 있습니다.

  • Feature

    • 유의사항

      • 최소 250 ng 이상의 gDNA가 필요하며, 증폭하고자 하는 locus의 sequence와 repeat 위치를 정확히 알려주셔야 합니다. (보내주신 시료 종류에 따라 필요한 농도와 정보는 달라질 수 있습니다.)
      • 샘플의 DNA 전기영동 사진을 첨부해 주셔야 합니다.

    • 실험 기간

      • 샘플 수령 후 약 4주 소요예정 (Running 만 진행하는 경우, 96 well 1 plate에 대한 분석은 sample 접수 후 1주 정도 소요됩니다. 분석하고자 하는 샘플 또는 target gene 증가에 따라 소요 시간이 변동 될 수 있습니다.)

    • 결과 전송

      • .fsa 파일을 e-mail로 보내드리며 추가 분석 요청 시 추가 비용이 발생 할 수 있습니다.
      • Peak scanner 프로그램을 원하시면 무료 제공

    • 보관 기간

      • 결과 data는 전송 후 6개월 보관. 샘플은 결과 전송 후 2주 보관

    • Related Product

      < Genomic DNA preparation >

      • DaBead™ Genomic DNA prep kit for Saliva, Epithelial cell (Magnetic Bead Type) [GD705-100]
      • DaBead™ Magnetic Separation Stand (120 x 58 x 37), 1.5㎖ x 12hole, 50㎖ x 2hole [SJ1-MSS11]

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      • BioFACT™ 2X Thumb Taq PCR Master Mix 1, w/o Band Helper™, with dye [TT301-50h]
      • BioFACT™ 2X H-Star Taq PCR Master Mix 1, w/o Band Helper™ , with dye [HS301-40h]

  • 분석과정 (Work Flow)

ASP (Allele Specific PCR) Service

바이오팩트에서 진행하는 ASP service는 DNA 염기서열의 차이에 따라 특정 Primer를 디자인하여 band 증폭 여부로 염기서열을 확인하는 서비스 입니다. DNA 염기서열 상의 유전적 변이를 특이적으로 확인하기 위한 PCR 방법 으로, 변이를 가지는 대립 유전자에 각각 특이 염기배열을 가지는 primer로 PCR을 수행합니다. 처음 allele specific PCR set-up시에는 시간과 비용이 많이 소요되나, 조건을 갖춰 놓으면 그 다음 부터는 "PCR→ 전기 영동" 한 번의 과정으로 손쉽게 SNP site를 확인 할 수 있습니다. 샘플 개수가 많고, SNP marker가 여러 개일 경우 효과적인 방법입니다.

  • ASP (Allele Specific PCR) Service Method & Result

    AFLP 와 T-RFLP Genotyping Serivce는 모든 전처리가 완료된 Sample 상태로만 접수가 가능하며, ABI 3130XL을 이용한 Running만 진행이 가능합니다.
    SNaPShot Genotyping Service의 최소 의뢰 수량은 384 sample 입니다. (1개 의뢰하셔도 384개 Sample 의뢰하는 비용이 청구됩니다.)

AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)

AFLP는 제한효소, adaptor, primer를 처리한 산물의 band 차이의 유무를 통해 종간의 차이를 분석하는 marker를 발견하는 실험입니다. PCR에 기본을 둔 분석 방법으로, 비교적 짧은 시간에 집단, 종간에 필요한 많은 정보를 얻을 수 있습니다. 또한 Adapter를 primer로 사용함으로써, 많은 수의 loci를 비교할 수 있습니다.

  • AFLP Method & Result

T-RFLP (Terminal-Restriction Fragment Length Polymorphism)

T-RFLP는 제한효소 처리 후 길이에 따른 다양성을 분석하는 실험으로, SNP site를 포함하는 부위가 특정 제한효소로 잘릴 수 있을 때, 사용할 수 있는 손쉬운 방법입니다. 주로 다양한 미생물이 포함된 시료에서 16s rRNA 유전자를 증폭한 후 제한효소를 이용하여 특정 염기서열을 절단 하였을 때 생기는 절편들의 길이를 비교할 수 있습니다. 본 방법을 통해 미생물의 다양성과 군집구조를 분석할 수 있습니다.

  • T-RFLP Method & Result

    • 본 서비스는 결과 분석 서비스는 제공되지 않습니다. (결과파일만 전송)
    • 본 서비스 의뢰 시 전기영동 사진은 첨부하지 않아도 됩니다.
    • 서비스 이용 시 학술서비스팀 또는 영업 담당자에게 별도 문의 후 의뢰하여 주시기 바랍니다.
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