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제품소개
SERVICE
16S & 18S rRNA
16S & 18S rRNA
Identification Full Service
바이오팩트에서 진행하는 16S & 18S rRNA Identification full service는 미생물 동정에 관하여 genomic DNA isolation 부터 sequencing까지 실험 모두를 진행해 드리는 서비스입니다.
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Feature
- 신속한 결과 : Sample 접수 후 2 ~ 4일 이내에 결과 발송
- 다양한 샘플 : Genomic DNA, colony 등 다양한 샘플에서 미생물 동정 가능
- Full service : Genomic DNA 추출부터 sequencing, 그리고 informatics analysis까지 full service
- 원인분석 Service : Fail result 에 따른 원인파악
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샘플 준비 방법 및
의뢰 시 유의사항샘플 준비 방법 및 의뢰 시 유의사항 비병원성 균주
(Bacteria, Yeast)병원성 균주 및 곰팡이 (방선균 포함) Genomic DNA 혹은 boiling한
상태로만 접수 받는 샘플 종류- 순수 배양된 단일 colony 또는 genomic DNA
순수 균주의 genomic DNA 추출이 힘들 경우 Boiling 후 보내 주시기 바랍니다. * Boiling 방법
- 1.5 ㎖ tube에 균주 샘플과 TE buffer 혹은 무균수를 100 - 200 ㎕ 넣고 100℃에서 10–15min 물중탕
- 곰팡이, 방선균, 병원에서 보내주는 샘플
- Bacteria 인지 곰팡이 인지 알 수 없는 균주
- 균주 특성상 바이오팩트 방법으로 DNA 추출이 어려운 경우 (only gDNA)
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실험 및 샘플보관 기간
- 실험 기간 : 샘플 수령 후 2 - 4일 이내에 실험 완료 및 결과 전송
- Sequencing data : 결과 전송 후 6개월 보관
- 샘플 보관 : 1주일 (gDNA일 경우 - 사전 별도 요청 시 1달 보관 가능)
- 샘플 반송 : order sheet에 기입해 주시거나 1주일 이내에 연락 주세요.
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결과 전송
- 샘플 수령 후 2 - 4일 이내에 실험 완료 및 결과 전송
- 제공 data
- Sequencing data (ab1, seq 파일)
- Informatics analysis 파일
- (고객 추가 요청 시 추가 전달, assembly, Blast search)
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Work Flow
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STEP.01gDNA 추출
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STEP.02PCR (유전자증폭) 및 정제
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STEP.03전기영동
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STEP.04염기서열분석
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미생물 동정에 사용되는 rRNA Gene region
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Bacteria , 유산균 등
16S rRNA Primer list (Universal) 27F AGAGTTTGATCCTGGCTCAG 337F GACTCCTACGGGAGGCWGCAG 518F CCAGCAGCCGCGGTAATAC 785F GGATTAGATACCCTGGTA 518R GTATTACCGCGGCTGCTGG 783R GTGGACTACCAGGGTATCTA 805R GACTACCAGGGTATCTAATC 907R CCG TCA ATT CMT TTR AGT TT 1492R TACGGYTACCTTGTTACGACTT -
Archaea 등
23S rRNA Primer list (Archaea) 1F TCCGAATGGGGAAACCC 9F AAGAGGGAAACARCCCAGA 10R GACCAGTGAGCTRTTAC 16R GGAACTTACCCGACAAGG 23R TTCGTGCTTAGATGCYTTCA -
16s-Archaea rRNA Primer list 21F TTCCGGTTGATCCYGCCGGA 344F ACGGGGCGCAGCAGGCGCGA 1492R TACGGYTACCTTGTTACGACTT -
Fungi, Yeast 등
ITS ITS1 TCCGTAGGTGAACCTGCGG ITS4 TCCTCCGCTTATTGATATGC -
18S rRNA NS1 GTAGTCATATGCTTGTCTC NS8 TGTTACGACTTTTACTT -
25S~28S rRNA NL1 GCATATCAATAAGCGGAGGAAAG NL4 GGTCCGTGTTTCAAGACGG LROR ACCCGCTGAACTTAAGC LR7 TACTACCACCAAGATCT LR12 GACTTAGAGGCGTTCAG
※ 다른 region 으로 분석하기 원하실 경우 1670-5695로 연락주세요.
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