PRODUCT

제품소개
SERVICE

Sequencing Service

바이오팩트 sequencing service는 유전적으로 가장 기본적인 정보를 제공하는 중요한 실험으로 다양한 template의 DNA를 chain termination method 와 Automatic sequencer(ABI 3730XL)를 이용하여 빠르고 정확하게 높은 품질의 염기서열을 제공합니다.
또한, purity, primer, high G+C 와 구조적인 문제 등의 원인 분석 서비스 제공, DNA preparation, PCR Purification 등의 연계 서비스를 제공하고 informatics 요청 시 assembly, blast, PDF 파일 등을 제공해 드립니다.

  • BIOFACT Sequencing Service 의 특징

    • 온라인 주문 system : www.genefact.net
    • 신속한 결과 발송 (샘플 접수 후 24시간 이내 결과 발송) 및 SMS 서비스 제공
    • PCR purification, Gel extraction, Plasmid prep, cell stock 등 연계 서비스 제공
    • 길고 정확한 결과 : 700bp 이상
    • Fail result에 대한 원인분석 서비스

  • 주문 시스템

    • 온라인 주문 시스템 <GeneFACT>

      www.genefact.net

    • 오프라인 주문 시스템 <Order sheet>

      GeneFACT site에서 다운 받으시거나 1670-5695로 연락주세요.

  • 분석과정 (Work Flow)

    • STEP.01

      주문하기
      Sample 발송
      • 온라인 (GeneFACT 가입 후 주문)
      • 오프라인 주문
      • 영업사원 전달, 택배 이용 가능
        (냉장 또는 냉동 배송 권장)

    • STEP.02

      Sequencing 접수 및
      Sample Quality 확인
      • SMS, e-mail 전송
      • 전기영동으로 확인 후
        Quality 낮은 Sample은 개별 연락

    • STEP.03

      SEQ 진행 시간
      • 오전 rxn AM10:00
      • 오후 rxn PM18:00

    • STEP.04

      결과발송
      • 오전 rxn : 오후 발송
      • 오후 rxn : 다음 날 발송
      • SMS, e-mail 발송

  • Sample & Primer 권장 농도 및 양

    Template Quality Volume
    PCR prodacuct 100~200bp 5ng/㎕ · 1rxn 당 10ul
    · rxn 추가시 1rxn 당 5㎕ 추가
    200~500bp 10ng/㎕
    500~1000bp 20ng/㎕
    1000~2000bp 20~40ng/㎕
    바이오팩트 보유 vector primer 바이오팩트 미보유 vector primer / 고객 primer
    무료 제공 · 1rxn 당 5㎕ (5pmol/㎕)
    · (rxn 추가 시 1rxn 당 3㎕ 추가)

    • 결과 전송 스케줄

      • 오전 rxn 이전 도착 샘플 : 당일 18시 이후 결과 발송
      • 오후 rxn 이전 도착 샘플 : 익일 18시 이전 결과 발송
      • Primer 제작 요청 샘플 : 1~2일 추가
      • Purification / Plasmid mini prep 요청 샘플 : 1일 추가

    • 보관기간

      • 샘플 및 primer : 1주일 (예외 : 요청 후 한 달)
      • Sequencing data : 6개월

  • Primer walking service

    • 일반 primer 분석 시

    • Primer walking 으로 분석 시

      • Primer walking 이란?
        일반 시퀀싱으로 1 rxn 분석시 700bp 내외가 분석 가능한데 product size가 이 보다 클 경우 inner primer 를 차례로 디자인하여 염기서열을 분석합니다.
        (walking) 보통 1.5kb 이상의 product 를 분석할 경우 이용하는 실험 방법입니다.
      • 실험 기간
        4일 / kb당 (walking day 기준)
      • 주의사항
        양방향에서 읽어가다가 구조로 인하여 더 이상 진행이 힘들 경우 문제가 없는 방향으로만 단일로 진행되어 위 실험기간보다 더 길어질 수 있습니다.
        Reference 가 있을 경우 primer 를 한 번에 디자인할 수 있어 결과 확인이 더욱 더 빨라질 수 있습니다.
      • 제공 data
        ab1, .seq, .fas (align)

  • 바이오팩트 보유 Universal Primer list

    NAME SEQUENCE (5' → 3') BASE PAIR
    BaculoVF TTTACTGTTTTCGTAACAGTTTTG 24
    BaculoVR AACGCACAGAATCTAGCGC 19
    BGH TAGAAGGCACAGTCGAGG 18
    CMV-ProF AAATGGGCGGTAGGCGTG 18
    CMV-ProR TCGTTGGGCGGTCAGC 16
    c-mycR CTCTTCTGAGATGAGTTTTTG 21
    EBVR GTGGTTTGTCCAAACTCATC 20
    EGFP-CF AGCACCCAGTCCGCCCTGAGC 21
    EGFP-CR CGTCCATGCCGAGAGTG 17
    EGFP-NR CGTCGCCGTCCAGCTC 16
    GAL1-ProF AACATTTTCGGTTTGTATTACTTC 24
    GAL4-ADF TACCACTACAATGGATGATG 20
    GAL4-BDF TCATCGGAAGAGAGTA 16
    GAL4-BD-NR TTTCTTTGGAGCACTTGAGC 20
    GFP-CF GGTCCTTCTTGAGTTTGTAAC 21
    GFP-NR CATCACCATCTAATTCAACAAG 22
    GL1 TGTATCTTATGGTACTGTAACTG 23
    GL2 CTTTATGTTTTTGGCGTCTTCCA 23
    GL4 GGGTAGAATGGCGCTGGG 18
    GST-CF GCATGGCCTTTGCAGGG 17
    LacZa-NR CCTCTTCGCTATTACGC 17
    LexAF CGTCAGCAGAGCTTCACCATTG 22
    Luc-CF AGAGAGATCCTCATAAAGGC 20
    Luc-NR CCTTATGCAGTTGCTCTCC 19
    M13-20F GTAAAACGACGGCCAGT 17
    M13-20R GGAAACAGCTATGACCATG 19
    M13-47F CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGA 23
    M13-48R AGCGGATAACAATTTCACACAGGA 24
    malEF GGTCGTCAGACTGTCGATGAAGCC 24
    NL1 GCATATCAATAAGCGGAGGA 20
    pBAD-3 ATCTGTATCAGGCTGAAAATC 21
    pBAD-5 CCATAGCATTTTTATCCATAAG 22
    pCMV6-3 CTGGGGAGGGGTCACAGGG 19
    pENTR-5 CTACAAACTCTTCCTGTTAGTTAG 24
    pETupstream ATGCGTCCGGCGTAGA 16
    pETdownstream ATAGTTCCTCCTTTCAGC 18
    pFlag-CMV-C24 TATTAGGACAAGGCTGGTGGGCAC 24
    pFlag-CMV-N30 AATGTCGTAATAACCCCGCCCCGTTGACGC 30
    NAME SEQUENCE (5' → 3') BASE PAIR
    pGAL4_AD-3 AGATGGTGCACGATGCACA 19
    pGAL4_BD-3 AATCATAAGAAATTCGCCC 19
    pGEX-3 CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG 23
    pGEX-5 GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG 23
    pQE-F CAATTTCACACAGAATTCATTAAAG 25
    pQE-R GAGCGTTCTGAACAAATCCAG 21
    pTrcHis-3 ATCTGTATCAGGCTGAAAATC 21
    pTrcHis-5 TTAAAGAGGTATATATTAATGTATCG 26
    RV3 CTAGCAAAATAGGCTGTCCC 20
    RV4 GACGATAGTCATGCCCCGCG 20
    SeqL-A GCAGTTCCCTACTCTCGC 18
    SeqL-B CATCAGAGATTTTGAGACAC 20
    SP6 TATTTAGGTGACACTATAG 18
    SV40-pAF AAATAAAGCAATAGCATCAC 20
    SV40-pAR GAAATTTGTGATGCTATTGC 20
    T3 AATTAACCCTCACTAAAGGG 20
    T7 TAATACGACTCACTATAGG 19
    T7ter GCTAGTTATTGCTCAGCG 18
    Trx-F TTCCTCGACGCTAACCTG 18
    U19 GTTTTCCCAGTCACGACGT 19
    XpressF AGCATGACTGGTGGACAG 18
    21F* TTCCGGTTGATCCYGCCGGA 20
    27F AGAGTTTGATCCTGGCTCAG 20
    337F GACTCCTACGGGAGGCWGCAG 21
    344F* ACGGGGCGCAGCAGGCGCGA 20
    518F CCAGCAGCCGCGGTAATAC 19
    518R GTATTACCGCGGCTGCTGG 19
    783R GTGGACTACCAGGGTATCTA 20
    785F GGATTAGATACCCTGGTA 18
    805R GACTACCAGGGTATCTAATC 20
    907R CCGTCAATTCMTTTRAGTTT 20
    1492R* TACGGYTACCTTGTTACGACTT 22
    ITS1 TCCGTAGGTGAACCTGCGG 19
    ITS4 TCCTCCGCTTATTGATATGC 20
    ITS5 GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG 22
    NL1 GCATATCAATAAGCGGAGGA 20
    NL4 GGTCCGTGTTTCAAGACGG 19
    21F ~ 1492R : 16S rRNA 분석용, *Archaea 분석가능,
    ITS1 ~ ITS4 : 18S rRNA 분석용

    ※ 제공되는 정보는 참고용으로 sequencing 의 일치 여부를 확인하시고 의뢰하시기 바랍니다.

  • 원인분석 & 특이구조 Sequencing 분석

    2차 구조나 repeat 구조, G+C content 가 많을 때 peak 이 감소하여 data 길이가 짧아 원하는 data 를 얻지 못할 때가 있습니다.
    이러한 경우 문제 해결을 위해 ㈜바이오팩트에서는 dGTP 조건, GC 조건 등 을 이용하여 원인 분석 및 향상된 data 를 제공하고 있습니다.

    GC 조건 / dGTP조건

    조건 적용 전
    • 분석 키트 : BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
    • 분석 기기 : ABI 3730XL DNA Analyser (50㎝ capillary)
    • 결과 data 형식 : ab1, seq 파일
    조건 적용 후

  • 운송 방법

    • Reaction 10개 이상 : 자사부담 / Reaction 10개 미만 : 고객부담
    • 대전지역 : 퀵서비스 및 자사수거 / 대전 외 지역 : 지사 및 대리점 문의, 택배, 화물 등
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